Precisamos de: 

1. Ligue o seu USB flash drive na porta USB e mova todo o conteúdo para um local seguro no seu HD, pois todo conteúdo será APAGADO!

2. Abra o prompt de comando (CMD) comoADMINISTRADOR, para isso clique no menu iniciar>todos os programas>acessórios e clique com o botão DIREITO do mouse em prompt de comando, em seguida em>"executar como administrador" .

3. Você precisara saber qual a letra de drive o Windows deu ao seu pen-drive:
para isso digite no prompt de comandoDISKPART (tecle ENTER) abrirá outra janela... Após digite na nova janela.LIST DISKvai aparecer todos os DISCOS que você possui no seu PC... É necessário muito cuidado na próxima etapa, pois você vai selecionar em modo texto o seu flash disk (ou pen-drive) para prepará-lo para o BOOT. Portanto.
preste muita atenção, o comando LIST DISK lhe mostra quais os DISCOS você possui no seu PC, (incluindo seu HD),
você deve VER qual disco é o seu PENDRIVE, (aquele que você quer preparar para o BOOT), ele ira mostrar os discos mais ou menos da seguinte forma... Ex=
No do disco status tamanho...
DISK0 ON-LINE 500GB
DISK1 ON-LINE 8000MB

4. No próximo passo digite os comandos abaixo em sequência.SELECT DISK 1(se este for o seu PENDRIVE ou flash disk, se seu PENDRIVE no resultado do LIST DISK aparecer como DISK2, então digite SELECT DISK 2,ok)
(usarei aqui o DISK 1 como mero Exemplo.)SELECT DISK 1(lembre-se, nesse caso, DISK 1 se esse for o seu DISK pen-drive, e pressione enter)CLEAN(pressione enter)CREATE PARTITION PRIMARY(pressione enter)SELECT PARTITION 1(pressione enter)ACTIVE(pressione enter)FORMAT FS=NTFS (pressione enter)(o processo de formatação talvez demore um pouco ok)ASSIGN(pressione enter)EXIT(pressione enter)(Não feche a janela do prompt, apenas minimize-a)
agora provavelmente seu Windows trocou a letra de drive do seu pen-drive, você precisa saber qual letra de drive o seu Windows designou para seu pen-drive, portanto, clique no ícone "meu computador" na área de trabalho e veja qual a LETRA drive atual do seu PENDRIVE.
ex.= H:
apos, COLOQUE O DISCO DE INSTALAÇÃO DO SISTEMA(WINDOWS
7, VISTA) NO DRIVE DE DVD,
volte lá no prompt de comando (aquele que você minimizou) e o maximize,
digite E:(e pressione ENTER.) se o “E” for a letra do seu drive de DVD é lógico.
caso o dispositivo de DVD esteja usando outra letra como drive, substitua pela letra atual.
digite..
CD BOOTe pressione ENTER.
apos, para atualizar o BOOTMGR código compatível ao boot do windows7 ou vista, digite:BOOTSECT.EXE/NT60 H: (o H: aqui mencionado é a letra do seu drive de USB, o pen-drive!, ok, se não for "H" no seu PC , substitua o H pela letra atual do seu dispositivo USB)
Agora é só copiar o disco de Instalação do Windows desejado para o PENDRIVE!
E pronto!